O município de Pejuçara juntamente com Ajuricaba, Campo Novo, Chiapetta, Condor, Coronel Barros, Nova Ramada, e Sede Nova, pertencentes a 17ª CRS, alcançaram 100% de desempenho no Programa Saúde na Escola, e, portanto, receberão incentivos financeiros para que sejam utilizados nas ações do PSE. Pejuçara receberá o valor de R$ 11.118,61, conforme Portaria  GM/MS N°5.608  de 12.11.2024. 
O Programa Saúde na Escola tem com a finalidade contribuir para a formação integral dos estudantes da rede pública de educação básica por meio de ações de prevenção, promoção e atenção à saúde.
No município, ele é desenvolvido na Escola Municipal Pejuçara; Escola Estadual Angelo Furian; EMEI Maria Schuster e Pró Infância.
Entre as ações do PSE, destacam-se:
• Prevenção das Infecções Sexualmente Transmissíveis (ISTs);
• Prevenção ao uso indevido do álcool, tabaco, crack e outras drogas;
• Promoção da Cidadania;
• Promoção da Atividade Física e do Lazer nas Escolas;
• Promoção e Avaliação da Saúde bucal;
• Acompanhamento Vacinal;
• Promoção da Nutrição e Alimentação Saudável;
• Promoção da Saúde Auditiva;
• Promoção da Saúde Ocular;
• Ações de Combate ao Mosquito Aedes Aegypti